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Infos zur Biochemievorlesung

Mario — Thu, 10 May 2007 15:28:15 +0000

Für alle, die es auf Grund der Überschneidung mit Algo oder sonstigen Gründen zur heutigen Vorlesung nicht geschafft haben, hier nochmals das Wichtigste zur Vorlesung “Allgemeine Biochemie” zusammengefasst:

Vorlesung findet statt am Do 10:15-11 Uhr und Fr 09:15-10:45 Uhr
Vorlesung morgen am 11. Mai fällt aus
Klausur findet statt am 25.10.07 im N7 von 14-17 Uhr
Nachklausur ist am 26.11.07, Raum und Zeit noch unklar – hängt davon ab wie viele durchfallen
Biologen finden das Wort “Algo” sehr amüsant

Es wird wieder ein Tutorium geben bei Herrn Helge Miller, welches ich nur empfehlen kann. Für dieses gibt es 2 Termine in der Woche:

Montag 11:15-13:00 Uhr
Dienstag 11:15-13:00 Uhr

Dieses findet im E-Bau in E3A40 statt.

Folien zur Vorlesung werden Online gestellt…vermutlich auf der Homepage des Instituts.
Ist aber noch nichts zu finden – der Benutzername und Passwort ist jedenfalls der selbe wie vor einem Jahr.

Kleines Terminupdate

Mario — Thu, 25 Jan 2007 18:41:02 +0000

Aufgrund einer Überschneidung des Mikrobiologischen Kurses und der Vorbesprechung für das PC-Praktikum, wurde die Vorbesprechung vom 1. Februar auf den 15. Februar um 13 Uhr im normalen PC-Hörsaal (N4?) gelegt.

Die Überschneidung der zweiten PC-Klausur mit dem Mikrobiologischen Kurs soll am ersten Kurstag durch den Kursleiter – Herrn Muth – gelöst werden.

Update:
Der am 8. Februar stattfindende Mikrobiologische Kurs wurde auf 8-12 Uhr vorverlegt, sodass es nun keine Überschneidung mit der PC-Klausur mehr gibt.

Und täglich grüßt die Chemie

Till Helge — Sat, 23 Dec 2006 10:27:43 +0000

Damit hier mal nicht nur Negatives steht, möchte ich ganz kurz noch zusammenfassen, was sich in Reaktion auf die Aktion mit der Klausur in physikalischer Chemie jetzt noch getan hat:

Für das restliche Semester und in Zukunft für das gesamte Semester haben die Bioinformatiker Übungen zur physikalischen Chemie. Das soll dafür sorgen, dass ein Verständnis für den Umgang mit den relevanten Formeln entsteht etc. Da eigentlich schon seit Beginn des Wintersemesters entsprechende Übungen in den Plan hineingehören, ist das zwar kein sonderlich unerwarteter Schritt, aber doch schön, dass sich da endlich etwas getan hat.

Da die Klausur durchweg so schlecht ausgefallen ist, wird wohl überlegt ein klein wenig am Maßstab zu drehen, damit eine Chance besteht in der zweiten Klausur (deren Termin sich nachwievor mit dem mikrobiologischen Kurs überschneidet, der ebenfalls eine Pflichtveranstaltung ist) genug Punkte zu holen, um letztendlich bestanden zu haben. Dazu gibt es aber keine konkreteren Informationen bisher.

Die Kritik ist also zumindest teilweise nicht ganz auf taube Ohre gestoßen. Inwieweit sich die Situation jetzt noch zum Positiven wendet was konkret den Jahrgang 2005 betrifft, bleibt abzuwarten. Aber so kann man zumindest etwas beruhigter in die “Ferien” gehen. In diesem Sinne:

Frohes Fest und einen guten Rutsch ins neue Jahr!

Bioinformatik III – Die Rache der Chemiker

Mario — Sat, 16 Dec 2006 13:14:12 +0000

Es herrscht eine betrübte Stimmung unter den Bioinformatikern. Einen Grund zur Freude hatte wohl keiner am Ende dieser Woche.
Vor 48 Stunden: Das Ende der Woche ist greifbar nahe, die Sonne scheint, es liegt jedoch eine dunkle Bedrohung in der Luft: die physikalische Chemie Klausur steht unmittelbar bevor.

Noch wissen wir nicht was uns auf uns zukommt.
60 Minuten später: Dank einem gut durchdachten und bis ins letzte Detail ausgetüffelten Sitzsystem finden alle Studenten in N7 auf Anhieb ihren Platz.
14:15 Uhr – die Schlacht beginnt.
Keine 24 Stunden später die Ernüchterung: Dem Aushang ist zu entnehmen: kein einziger Bioinformatiker hat die 50% geschafft, die es zu erreichen galt. Schnitt 25%. 100% Durchfallquote. Fragen werfen sich auf: Ist eine angemessene Korrektur von rund 150 Klausuren in weniger als 24h möglich? Warum hat kein Bioinformatiker bestanden? Lag es daran, dass wir keine Übungsblätter und Tutorien hatten? Lag es daran, dass wir die Klausur unterschätzt haben (Stichwort 1-2 Rechenaufgaben? Steckt dahinter ein tieferer Sinn, den wir nicht durchschauen?

Ich für meinen Teil bin etwas enttäuscht – über die (unangemessene) Klausur selbst – über das Schnellkorrekturverfahren und ein etwas übersichtlicheres Skript wäre auch nett gewesen.

Fühlt euch frei zu kommentieren. ;)

Praktikum Physikalische Chemie

Till Helge — Sat, 02 Dec 2006 08:24:10 +0000

In den letzten Tagen gab es sehr unterschiedliche Meinungen zum Thema “Praktikum Physikalische Chemie”. Da gab es eine Fraktion, die behauptet hat, dass man sich bis Donnerstag hätte anmelden müssen. Die andere hat von einem Zeitraum im Dezember gesprochen, in dem die Anmeldung möglich ist. Auf Nachfrage bei Frau Doez habe ich nun eine klärende Antwort für alle:

Die Frist im Dezember war offensichtlich eine Fehlinformation. Wir hätten uns tatsächlich diese Woche anmelden müssen. Frau Doez meinte aber, dass wir durchaus auch nächste Woche vorbeikommen können, um uns anzumelden, da sie selber von der Anmeldefrist garnichts wusste und unser Praktikum überhaupt noch garnicht irgendwie eingeplant ist. Damit ist noch nichts zu spät und alles überhaupt kein Problem. Ergo:

Vom 4.12. bis 8.12. unbedingt bei Frau Doez (B8A37) zwischen 9 und 11 oder 13 und 15 Uhr für das physikalische Chemie Praktikum anmelden!

Details zu den Chemie-Protokollen

Mario — Thu, 24 Aug 2006 21:12:48 +0000

Da viele Leute (mich eingeschlossen) nicht schlecht gestaunt haben, als sie feststellen mussten, dass auf nahezu jeder Seite des Protokolls etwas rot beanstandet war, und schon sich schon mit dem unangenehmen Gedanken rumgeschlagen haben, das komplette Protokoll neu zu schreiben, möchte ich euch folgende, vielleicht etwas aufheiternde Nachricht nach Rücksprache mit Peter verkünden:

Solange es sich nur um kleinere Fehler handelt (z.B. die Oxidationszahlen von einer Reaktion, Rechenfehler oder Fehler in einer
Strukturformel) genügt es vollkommen diese Fehler auf der Rückseite bzw. auf einem Extrablatt zu verbessern. Ihr müsst also nicht die ganze Seite komplett neu abschreiben. Was jetzt genau kleinere Fehler von “dummem Bockmist” unterscheidet, vermag ich auch nicht allgemein zu sagen. Das müsst ihr selber beurteilen können. :)

Chemie-Prüfung

Mario — Fri, 18 Aug 2006 11:05:33 +0000

Da es offensichtlich etwas Verwirrung in letzter Zeit bezüglich den Anmeldemodalitäten für die mündliche Prüfung in Chemie gab, habe ich mich mal kurz bei Frau Weber erkundigt, wie das ganze für die Bachelorleute aussieht. Und zwar sind die Bachelors automatisch angemeldet, d.h. ihr könnt beruhigt in Urlaub fahren und am Strand liegen, während die Diplomer das Studiensekretariat belagern.
Sobald die Termine für uns Bachelors bekannt sind, werden diese per Aushang und im Netz bekanntgegeben.

Die ZMG-Verwirrung

Till Helge — Thu, 13 Jul 2006 15:28:36 +0000

Um 14 Uhr war heute die Vorbesprechung zu einem “Genetischen Kurs”, von dem bis vor wenigen Tagen kaum jemand etwas gehört hatte. Die ersten 30 Minuten dieser Vorbesprechung bestand dann daraus, dass uns die Namen der Biologen vorgelesen wurden, die sich für den zellbiologischen Kurs angemeldet hatten. Doch was genau hat das mit uns zu tun? Genau. Garnichts. Nach diesen 40 unsinnig verbrachten Minuten kam dann endlich der Teil, der für uns von Interesse ist:

ZMG ist die zusammenfassende Abkürzung für Zellbiologie, Mikrobiologie und Genetik. Alle drei Fachbereiche sind in unserem Studienplan vertreten. Bisher gab es dann eine (die berüchtigte) ZMG-Klausur über alle drei Veranstaltungen am Ende des vierten Semesters. Die wurde jetzt aber offensichtlich wegrationalisiert und stattdessen machen wir jetzt einen genetischen Kurs und einen mikrobiologischen Kurs. Zumindest ist das das vorläufige Ergebnis der Vorbesprechung. Es stellte sich nämlich heraus, dass im Biologie-Bau eine Liste auslag, in der wir uns hätten eintragen sollen. Da das aber niemand wusste, war die Liste auch komplett leer. Einen herzlichen Applaus an dieser Stelle bitte für den grandiosen Informationsfluss.

Jetzt aber mal Nägel mit Köpfen: Ich versuche mal zusammenzufassen, was nun für uns auf dem Plan steht:

6. November ‘06 bis 13. Dezember ‘06:
Jeden Montag, 14 bis 18 Uhr: Genetischer Kurs
29. Januar ‘07 bis 17. Feburar ‘07:
Jeden Montag und Donnerstag, 14 bis 18 Uhr: Mikrobiologischer Kurs

Zum genetischen Kurs wird es Anfang Oktober ein Skript geben, das auf der Homepage des Institus zum Download bereit steht. Es ist nicht Pflicht, aber wird empfohlen vor dem Praktikum durchzulesen und es ausgedruckt mitzubringen, so weit ich das verstanden habe. Für die Mikrobiologie sind die Informationen etwas rar, da der zuständige Dozent nicht anwesend war. Vermutlich kriegen wir die Informationen aber noch irgendwie nachgereicht. (Ich bin gespannt…)

Soviel erst einmal zu meinem Versuch Licht ins Dunkle zu bringen. Wenn sich neue Informationen ergeben, werden die hier natürlich ergänzt.

Tierphysiologischer Kurs, Teil 2

Till Helge — Sat, 08 Apr 2006 08:47:42 +0000

Nun liegt der eigentliche Kurs hinter uns. Vor uns liegt jetzt bis Mai noch die Phase der Protokoll-Korrektur, da bis zur Klausur alle Protokolle von den Kursleiter abgesegnet sein müssen. Aber noch einmal zum Kurs selber:

Muskelphysiologie
Auch diesmal musste wieder ein Frosch dran glauben. Am Wadenmuskel, der über den Ischiasnerv zur Kontraktion gebracht wurde, haben wir die Kraft in Abhängigkeit von Reizfrequenz, Reizintensität und Ausgangsspannung gemessen. Anschließend haben wir noch den Muskel direkt über eine eingestochene Elektrode gereizt und wieder die Kraft am Oszilloskop abgelesen.
Der zweite Versuch des Tages sollte die Wirkung von Adrenalin, Acetylcholin und Atropin auf den Herzschlag zeigen. Dazu haben wir das Herz des Froschs freigelegt und an einen Messaufbau angeschlossen. Das Herz hat sich ganz vorbildlich verhalten und zuerst schneller, dann langsamer und zum Schluss fast garnicht mehr geschlagen. Atropin hat es dann wieder in Schwung gebracht.
Zum Schluss haben wir noch ein Elektromyogramm eines menschlichen Muskels angefertigt.
Die Versuche haben alle gut geklappt, aber auch eine Menge Zeit in Anspruch genommen. Das war der längste Versuchstag. Das Schreiben des Protokolls am nächsten Tag war dann auch nicht gerade einfach und wir hatten am Ende wieder 20 Seiten zusammen.

Insekten-ERG
ERG steht für Elektroretinogramm. Daraus leitet sich auch schon sehr genau ab, was wir am letzten Kurstag vor uns hatten: Die Messung elektrischer Potenziale im Auge einer Fliege. Zu diesem Zweck wurde eine Fliege auf einem Träger fixiert und in einen Versuchsaufbau gesteckt, so dass eine Elektrode auf dem Auge und die zweite im Torso steckend positioniert waren. Nun wurde mit Licht unterschiedlicher Wellenlänge und Intensität das Auge gereizt und die Antwort der Photorezeptoren, sowie die Aktionspotenziale der Nervenzellen gemessen. Nachdem wir so unter anderem die Spektralempfindlichkeit der Fliege bestimmt hatten, haben wir noch mit einer blitzenden LED die Frequenz bestimmt, bei der die Fliege keine einzelnen Lichtblitze mehr erkennen kann. Diese Frequenz haben wir dann auch für unsere Augen bestimmt und verglichen: Sie liegt bei der Fliege gut viermal so hoch als bei uns.
Das Protokoll für diesen Versuchstag ist das kürzeste der vier mit “nur” 12 Seiten.

Ich wage mal ein kleines Fazit für den gesamten Kurs zu formulieren: Die Versuche waren weitestgehend sehr interessant. Man konnte die Theorie, die teilweise ja aus der Schule schon bekannt ist, praktisch überprüfen und so viele Dinge erfahren, die man sonst sicherlich nicht mitbekommen hätte. Mich persönlich hat beispielsweise der Frosch sehr beeindruckt, da ich nicht wirklich erwartet hatte, dass man Organe wirklich farbig so gut unterscheiden kann. Möglichkeiten, so etwas zu sehen, hat man ja nicht oft und ich bin recht froh, dass uns diese zur Verfügung gestellt wurde.
Wünschenswert wäre gewesen, dass zwischen den Versuchstagen mehr Zeit liegt, damit man die Protokolle etwas entspannter angehen kann und für die Vorbereitung auf den nächsten Kurstag mehr Zeit zur Verfügung steht.
Ein Lob auch an das Team um Professor Ilg: Der Ablauf hat mir gut gefallen und das Klima war sehr angenehm.

Bleibt nur noch zu hoffen, dass die Protokolle schnell den Ansprüchen entsprechen und abgehakt werden können.

Auch die letzten beiden Protokolle werde ich eventuell hier noch dazupacken.

Tierphysiologischer Kurs, Teil 1

Till Helge — Sun, 02 Apr 2006 17:31:24 +0000

Diese Woche war für alle Bioinformatiker von einem Begriff geprägt: Tierphysiologischer Kurs. Erwähnt habe ich ja schon mehrmals, dass dieser für uns fester Bestandteil des Studiums ist. Nun liegen 2 von 4 Kurstagen hinter uns und ich möchte mal eine erste Zusammenfassung schreiben:

Psychophysik
Dienstag war meine Gruppe für die Versuche um Ohr, Auge und Kniesehnenreflex eingeteilt. Wir hatten eigentlich keine Ahnung, was uns erwartet und saßen etwas unsicher in der Gegend herum. Nach einem Gespräch mit dem zuständigen Kursleiter, bei dem er herausfinden wollte, ob wir uns ordentlich auf die Versuche vorbereitet haben, ging es dann frisch ans Werk. Für das erste Experiment mussten wir Augenbewegungen mittels eines Infrarotsensors protokollieren. Die Kalibrierung des Sensors war etwas mühsam und der Umgang mit dem DOS-Betriebssystem mehr als ungewohnt, aber letztendlich hatten wir unsere Ergebnisse: Diagramme von den Augenbewegungen beim Lesen, beim Verfolgen einer fließenden Bewegung und beim Fixieren von zufällig auftauchenden Punkten.

An der zweiten Station erwarteten uns mehrere Versuche zur Bestimmung der absoluten Hörschwelle des Menschen und des Zusammenhangs zwischen Abstand und Lautstärke von akustischen Signalen zur Lokalisation von Sinneseindrücken. Diese waren definitiv die schwierigsten, da es für die jeweilige Versuchsperson unheimlich schwierig war, genaue Angaben zu machen.

Am Ende des Tags haben wir dann noch Messreihen zum Kniesehnenreflex unter verschiedenen Bedingungen gemacht. Damit war der Tag dann rum.

Das Schreiben des Protokolls hat uns dann den gesamten nächsten Tag beschäftigt und am Ende hatte unsere PDF 22 Seiten. Warten wir mal die Korrekturwünsche des Kursleiters ab.

Nervenphysiologie
Den zweiten Kurstag (Donnerstag) hatten wir uns in der Vorbereitung als schwieriger und aufwändiger ausgemalt, jedoch waren wir fast zwei Stunden eher fertig als am Dienstag. Diesmal sollten wir uns mit Messungen an einem echten Nerven befassen. Nach der Vorbesprechung und der Überprüfung, ob wir vorbereitet sind, wurde zu diesem Zweck ein Krallenfrosch von der Kursleiterin getötet, gehäutet, ausgeweidet und so weit präpariert, dass wir den Ischiasnerv freilegen konnten. An diesem haben wir dann verschiedene Versuche durchgeführt und hatten am Ende mindestens 25 Ausdrucke des Oszilloskops und eine Menge Messdaten. Ermittelt haben wir beispielsweise die Leitungsgeschwindigkeit, die Zeitkonstante und die Wirkung von Betäubungsmitteln.

Diesmal konnten wir uns für das Protokoll etwas mehr Zeit lassen und kamen am Ende auf 18 Seiten, die wir erfreulicherweise per eMail einreichen durften. In der kommenden Woche erwarten uns jetzt noch Versuche zu Muskelphysiologie und Funktionsweise von Insektenaugen.

Die fertigen Protokolle werde ich unter Umständen hier nachreichen.